Mortal Kombat 12 deve ser lançado ainda em 2023, conforme revelado pelo próprio vice-presidente executivo de estratégia da Warner Bros. Discovery, Andrew Slabin, em uma teleconferência de resultados com investidores em 23 de fevereiro. Diante da novidade, um dos principais mistérios sobre MK 12 gira em torno da história, uma vez que a expansão Aftermath de Mortal Kombat 11 tem dois finais completamente distintos.
A exemplo do que ocorre em Injustice 2, outro jogo de luta desenvolvido pela NetherRealm, Mortal Kombat 11: Aftermath, tem dois finais: um bom no qual Liu Kang sai vitorioso na batalha final contra Shang Tsung pela coroa da vilã Kronika, e outro ruim, em que Shang Tsung derrota Liu Kang.
Em ambos os finais, tanto Liu Kang qunto Shang Tsung utilizam a coroa de Kronika e decidem reestruturar a linha do tempo, mas com objetivos completamente distintos, mas ambos podem servir como ponto de partida para a história de Mortal Kombat 12.
Final 1: Liu Kang ascende como novo Deus do Trovão e do Fogo e se encontra com o primeiro Kung Lao
Neste final, considerado o mais positivo de Mortal Kombat 11: Aftermath, Liu Kang consegue derrotar Shang Tsung mesmo após o feiticeiro absorver a alma de Kronika, assume o controle da coroa da titã e molda as areias do tempo para inaugurar uma nova cronologia no universo de Mortal Kombat, agora com o próprio Liu Kang assumindo o posto de Deus do Trovão e do Fogo após receber os poderes de Raiden.
No final da cena de corte, Liu Kang aparece no templo dos monges shaolin da Sociedade da Lotus Branca e se encontra com o Grande Kung Lao, ancestral do Kung Lao da linha do tempo mais recente de Mortal Kombat e primeiro humano. Liu Kang revela a Kung Lao que escolheu o monge Shao Lin como "seu campeão", o que indica que mesmo nessa nova linha do tempo, a Terra ainda precisará de defensores no torneio Mortal Kombat.
Caso a NetherRealm escolha este final como o verdadeiro, é provável que o elenco de Mortal Kombat passe por uma grande reformulação, pois o primeiro Kung Lao não é contemporâneo de guerreiros como Sonya Blade, Johnny Cage, Jax Briggs e outros. No entanto, como Liu Kang manipulou as areias do tempo, é possível que todos esses guerreiros tenham nascido na mesma época do Grande Kung Lao, o que abriria possibilidade de um Mortal Kombat ambientado séculos antes dos games mais recentes.
Final 2: Shang Tsung se torna um Deus Ancestral e tem Raiden e Fujin como servos
No final ruim de Mortal Kombat 11: Aftermath, Shang Tsung absorve as almas de Kronika e Liu Kang, manipula livremente as areias do tempo e inicia uma cadeia de eventos que, ao que tudo indica, culmina na ascensão do feiticeiro como único Deus Ancestral na nova linha do tempo.
Com poderes praticamente absolutos e sem nenhum guerreiro do Plano Terreno ou divindade capaz de impedi-lo, Shang Tsung torna deuses como Raiden e Fujin lacaios de estimação com a missão de conquistar todos os reinos.
Com Exoterra, Plano Terreno e Submundo conquistados pelos deuses do Trovão e do Vento a serviço de Shang Tsung, um cenário de terror é provavelmente iniciado, e uma possibilidade de história plausível seria a aliança entre os guerreiros desses planos para enfrentar Shang Tsung, Raiden, Fujin e companhia. Neste caso, seria possível ver até mesmo Liu Kang e Shao Khan formarem uma aliança, por exemplo, embora ainda seja um mistério qual deles teria poder suficiente para enfrentar Shang Tsung com tamanho nível de poder.